多组学研究揭示了感染HIV1细胞的特征

2020-07-30 21:57

为了消除HIV-1感染,重要的是阐明体内HIV-1感染细胞的详细特征和异质性。在这项研究中,感染了基因修饰的HIV-1的造血干细胞移植的人源化小鼠模型被用于揭示体内产生HIV-1的细胞的多种特征。

多组学研究揭示了感染HIV1细胞的特征

东京大学医学研究所(IMSUT)的一个研究小组使用感染了HIV-1的细胞进行了“多组学”分析,这是最近开发出来的用于全面研究生物样品特征的技术。

“我们的发现描述了体内产生HIV-1的细胞的多种特征,这可能为开发HIV-1疗法提供了线索。”首席科学家Kei Sato,副研究员(首席研究员)说。 IMSUT,传染病控制系,系统病毒学。

这项研究的结果发表在2020年7月14日的Cell Reports中。

研究“ HIV-1疗法”

为了消除HIV-1感染,重要的是深入了解HIV-1感染的体内细胞的广泛特性。

最近开发的“组学”分析(* 1)可以成为识别HIV-1感染细胞特征的有力工具。但是,应注意,感染个体中的大部分CD4 + T细胞(* 2)未被感染,因此,体内“大量” CD4 + T细胞的转录谱不能反映“纯” HIV- 1个产生细胞。

多元组学分析可全面揭示体内感染HIV-1的细胞的特征

在这项研究中,研究小组使用了移植有人类造血干细胞的人源化小鼠模型,该模型在体内相对稳定的免疫条件下维持人白细胞生成,并具有复制能力的报告基因HIV-1,并使用了四种最新开发的技术来研究病毒基因组学和转录组学。

根据研究小组的说法,这项研究包括以下四项分析:

首先,液滴数字PCR揭示了在感染的人源化小鼠中存在潜在的宿主。其次,如整合位点的表观遗传修饰与病毒产生的关联所表明的,连接介导的PCR显示了HIV-1倾向于整合到开放的染色质区域中的暗示。第三,数字RNA测序可定量体内HIV-1产生细胞中病毒转录本的绝对拷贝数,并进一步鉴定出病毒感染和未感染细胞之间差异表达的基因。最后,单细胞RNA测序揭示并表征了体内产生HIV-1的细胞的异质性。

佐藤副教授强调:“据我们所知,这项研究是描述HIV-1产生细胞多个方面的第一个研究,也是体内HIV-1感染细胞特征的第一个综合研究”。


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